Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ggta1P23336 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms