Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PparaP23204 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PparaP23204 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PparaP23204 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PparaP23204 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PparaP23204 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PparaP23204 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms