Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18529 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
P18529 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18529 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18529 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18529 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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