Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PtpraP18052 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PtpraP18052 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms