Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tgfb3P17125 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tgfb3P17125 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms