Protein–RNA interactions for Protein: P14106

C1qb, Complement C1q subcomponent subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qbP14106 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C1qbP14106 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C1qbP14106 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms