Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Schip1P0DPB4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms