Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxa5P09021 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Hoxa5P09021 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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