Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb1P04202 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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