Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ccl20O89093 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Ccl20O89093 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ccl20O89093 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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