Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctnnal1O88327 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnnal1O88327 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms