Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CtssO70370 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CtssO70370 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CtssO70370 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtssO70370 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtssO70370 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtssO70370 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms