Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LatO54957 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LatO54957 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LatO54957 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LatO54957 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms