Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Nedd9O35177 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nedd9O35177 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Nedd9O35177 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nedd9O35177 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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