Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Eftud2O08810 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms