Protein–RNA interactions for Protein: L7N298

Gm3424, Predicted gene 3424, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3424L7N298 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3424L7N298 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3424L7N298 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3424L7N298 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm3424L7N298 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm3424L7N298 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm3424L7N298 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Gm3424L7N298 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3424L7N298 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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