Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm379J3QQ19 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm379J3QQ19 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms