Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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