Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arfip1G5E8V9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arfip1G5E8V9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms