Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srp72F8VQC1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms