Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm5218F6YH22 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms