Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20518E9Q548 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20518E9Q548 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms