Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm17727E9Q4V7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm17727E9Q4V7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm17727E9Q4V7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm17727E9Q4V7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17727E9Q4V7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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