Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms