Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc8D3YZV8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms