Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms