Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11127A7VMS2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm11127A7VMS2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm11127A7VMS2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11127A7VMS2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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