Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CatsperbA2RTF1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 620.2 ms