Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms