Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms