Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
B020011L13RikA0A087WQI7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms