Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trbv31A0A075B5J5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv31A0A075B5J5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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