Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 MGAM-202ENST00000475668 9172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
HERC1Q15751 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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