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| BRD3 | Q15059 | AC008694.2-201 | ENST00000517591 | 306 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC009712.1-201 | ENST00000564938 | 316 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC103792.1-201 | ENST00000603591 | 919 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF75A-210 | ENST00000617839 | 1225 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000484.1-201 | ENST00000620067 | 1252 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | SMARCA2-229 | ENST00000634781 | 1106 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZMYND11-209 | ENST00000402736 | 3950 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM91A3P-201 | ENST00000456826 | 2544 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | ARHGAP5-206 | ENST00000539826 | 4881 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | MNS1-201 | ENST00000260453 | 2023 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC02475-202 | ENST00000512678 | 2622 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AFTPH-205 | ENST00000422803 | 1525 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | BCLAF1-214 | ENST00000531224 | 7263 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF480-202 | ENST00000335090 | 2722 nt | TSL 3 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | STARD4-201 | ENST00000296632 | 4606 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | POSTN-210 | ENST00000541481 | 3113 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL360270.1-201 | ENST00000440689 | 2359 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090337.1-201 | ENST00000579651 | 2074 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC024337.2-201 | ENST00000616608 | 2797 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | CCNT2-201 | ENST00000264157 | 6917 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | LRRC49-222 | ENST00000560158 | 1898 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | U8.4-201 | ENST00000363626 | 134 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-263P-201 | ENST00000363811 | 107 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM26F-203 | ENST00000368606 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| BRD3 | Q15059 | C9orf92-201 | ENST00000380683 | 359 nt | APPRIS P2 TSL 3 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |