Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BRD3Q15059 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BRD3Q15059 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms