Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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