Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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PTPRAP18433 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRAP18433 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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