Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms