Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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ECM1Q16610 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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