Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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SYCP1Q15431 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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