Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
R3HDM1Q15032 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
R3HDM1Q15032 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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