Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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COL19A1Q14993 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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