Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms