Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTCH1Q13635 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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