Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
DUSP4Q13115 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms