Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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