Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms