Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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