Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
TTPAP49638 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
TTPAP49638 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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