Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRMP28827 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRMP28827 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRMP28827 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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PTPRMP28827 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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