Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4Q9P0V3 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms